2023年9月11日 · 文章介绍了如何使用R语言的ggplot2包来绘制KEGG信号通路的气泡图。 首先,需要将数据处理成特定格式并保存为Excel文件,然后使用openxlsx包读取数据。 接着,通 …
二、气泡图绘制. 1,什么是气泡图? 2,三步绘制一张气泡图. 3,绘制一张多分类气泡图. 气泡图常见问题; 三、与其他在线作图网站相比,我们的气泡图优势. 四、微生信简介
因此,在一些高分文献中则会使用更高效的气泡图(Bubble图)来展示富集分析结果。 富集分析气泡图是在 笛卡尔坐标系 中加入数量、p值等参数表示三个变量关系的图形。
2025年1月14日 · 气泡图横纵坐标各是一个变量,第三个变量用气泡的大小来表示,与此同时还可以加入一个表示大小的变量进行比对。 在生信分析中,GO/ KEGG 功能注释和 富集 分析 气 …
2021年11月23日 · go/kegg富集分析及r包绘图(气泡图/条形图) 导读. 利用富集分析,我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如:tp53信 …
平常我们所见到的的气泡图有很多,如上图这是一个比较简单的气泡图,但具有一定的代表性。 首先我们来看横坐标,名称是geneRatio,它是通过计算我们的目标基因富集到目的通路基因个 …
这三种图形的不同点在于它们展现的维度不一样,即——散点图:从x, y轴二维 展示数据;普通气泡图:只有一种颜色,从x,y轴,气泡大小三维数据展示;高级气泡图:彩色,多了一抹妖 …
2024年8月2日 · kegg气泡图是一种可视化工具,用于展示基因或蛋白质在生物代谢途径或功能分类中的分布情况。 这种图形化表示方法可以帮助研究人员快速识别和理解生物系统中的模式和 …
2024年7月8日 · 2022年发表在《Nature communication》上的文章Kir2.1-mediated membrane potential promotes nutrient acquisition and inflammation through regulation of nutrient …
2020年8月5日 · 对生信分析中得到的一些基因,进行kegg富集分析,达到对基因进行注释和分类的目的。 本文利用R语言的ggplot2包,从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。